Optimierungsstrategien für das Docking flexibler Moleküle
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Verlag:VDM
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Beschreibung
Produktdetails
Einband
Taschenbuch
Erscheinungsdatum
16.11.2007
Abbildungen
IX, mit Abbildungen 24 cm
Verlag
VDMSeitenzahl
125
Maße (L/B/H)
24/17/0.9 cm
Gewicht
255 g
Sprache
Deutsch
ISBN
978-3-8364-3295-5
In den letzten Jahren ist strukturbasiertes virtuelles Screening zu einem
wichtigen Schritt in der Erforschung neuer Wirkstoffe avanciert. Hier wird
versucht, den Bindungsmodus zwischen einem Liganden, dem Wirkstoff, und
einem Rezeptor, i.d.R. ein Protein, samt Bindungsaffinität am Computer
vorherzusagen. Der Autor Axel Griewel gibt einführend einen Überblick über
verschiedene Ansätze zur Lösung dieses Problems sowie eine Einführung in
die algorithmischen Grundlagen des der Untersuchung zugrunde liegenden
Programms FlexX. Anschliessend wird ein Branch&Bound Algorithmus samt
Suchstrategie für den inkrementellen Aufbau von Liganden in
Rezeptortaschen vorgestellt. Die Evaluierung des Verfahrens erfolgt anhand
von 169 Komplexen und zeigt eine hohe Genauigkeit bei der Platzierung der
Liganden in der Tasche bei höherem Laufzeitbedarf. Des Weiteren wird eine
Gegenüberstellung zu den Ergebnissen der k-greedy Strategie vorgenommen.
Dieses Buch richtet sich an Forschende in der Chemie- und Bioinformatik
sowie an Anwender von Tools zum virtuellen Screening in der
pharmazeutischen Industrie.
wichtigen Schritt in der Erforschung neuer Wirkstoffe avanciert. Hier wird
versucht, den Bindungsmodus zwischen einem Liganden, dem Wirkstoff, und
einem Rezeptor, i.d.R. ein Protein, samt Bindungsaffinität am Computer
vorherzusagen. Der Autor Axel Griewel gibt einführend einen Überblick über
verschiedene Ansätze zur Lösung dieses Problems sowie eine Einführung in
die algorithmischen Grundlagen des der Untersuchung zugrunde liegenden
Programms FlexX. Anschliessend wird ein Branch&Bound Algorithmus samt
Suchstrategie für den inkrementellen Aufbau von Liganden in
Rezeptortaschen vorgestellt. Die Evaluierung des Verfahrens erfolgt anhand
von 169 Komplexen und zeigt eine hohe Genauigkeit bei der Platzierung der
Liganden in der Tasche bei höherem Laufzeitbedarf. Des Weiteren wird eine
Gegenüberstellung zu den Ergebnissen der k-greedy Strategie vorgenommen.
Dieses Buch richtet sich an Forschende in der Chemie- und Bioinformatik
sowie an Anwender von Tools zum virtuellen Screening in der
pharmazeutischen Industrie.
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