Methoden zur SH2-Bindungsvorhersage Entwicklung und Evaluierung
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Beschreibung
Produktdetails
Einband
Taschenbuch
Erscheinungsdatum
27.03.2012
Verlag
AV AkademikerverlagSeitenzahl
96
Maße (L/B/H)
22/15/0.7 cm
Gewicht
161 g
Sprache
Deutsch
ISBN
978-3-639-39380-4
Src-Homologie-2-Domänen (SH2) sind ca. 100 Aminosäuren lange Peptid-Bindungsmodule, die an verschiedenen therapeutisch relevanten zellulären Prozessen beteiligt sind. Die Identifizierung der spezifischen Wechselwirkungspartner einer SH2-Domäne ist von elementarer Bedeutung für das Verständnis ihrer biologischen Funktion und für eine zuverlässige Bestimmung ihrer Angriffsziele. Für diese Arbeit wurde eine Evaluierung der SMALI(scoring matrix-assisted ligand identication)-Algorithmen auf einer erweiterten Menge von 120 SH2-Domänen durchgeführt. Dabei fanden experimentell bestimmte SMALI-Matrizen für 76 Domänen Verwendung zur Vorhersage der Matrizen für die restlichen 44 Domänen. Für die Vorhersagen wurden eine Analyse der Homologie der SH2-Domänen sowie eine Strukturanalyse der 3D-SH2-Domäne-Ligand-Komplexe zur Bestimmung der mit Liganden interagierenden Positionen der SH2-Domänen durchgeführt.
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