I metalli pesanti sono presenti naturalmente nel suolo come elementi rari. I metalli pesanti, come il Cu e lo Zn, sono essenziali per la normale crescita e lo sviluppo delle piante, poiché costituiscono molti enzimi e altre proteine. Tuttavia, concentrazioni elevate di metalli pesanti, sia essenziali sia non essenziali, nel suolo possono provocare sintomi di tossicità e inibizione della crescita. La presenza di metalli pesanti può influire sull'attività enzimatica delle piante e dell'uomo.
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