Les espèces du genre Brachypodium se caractérisent par une forte variation génétique et des hybridations fréquentes. Dans le cadre de cette étude, visant à évaluer la variation génétique du complexe B. distachyon en Tunisie, 180 accessions de Brachypodium collectées dans différentes régions ont été analysées à l'aide de 18 caractères morphologiques et de 15 marqueurs SSR. Une forte variation morphologique a été mise en évidence pour la majorité des caractères analysés. Un chevauchement morphologique significatif a été observé entre les trois espèces pour la majorité des caractères analysés, indiquant une grande similitude phénotypique. La majorité des caractères ont présenté des niveaux d'héritabilité élevés, avec une moyenne de 0,62 pour l'ensemble des caractères, ce qui indique leur utilité pour tout programme de sélection. Au niveau moléculaire, les 15 marqueurs SSR se sont révélés très informatifs en termes de polymorphisme et de diversité allélique (P = 100 %, Na = 20,3 et Ne = 10,8). B. hybridum s'est révélé beaucoup plus variable que B. stacei et B. distachyon (He = 0,86, He = 0,78 et He = 0,58, respectivement). L'analyse FCA et le regroupement bayésien ont montré une séparation claire entre les trois espèces, tandis que le regroupement UPGMA a séparé B. distachyon de B. stacei et B. hybridum.
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